Der Fehler ist nicht Serverseitig - @ChristianM hat schon die gleiche Idee wie ich, die Config Datei welche die validen Signaturen enthält hat ein Problem in Euren Systemen. Ein manuelles Updates welches zwangsweise ausgeführt wird ignoriert dieses Datei und installiert wieder die neue Version vom gerade installierten Agenten.
Ich würde auch einfach mal schauen wenn das Problem wieder da ist wie die Agent Config Datei auf dem betroffenen System ausschaut und diese mit einem OK System vergleichen.