Tja. Wenn schon der Mensch das nicht erkennen kann, wie soll dann die Maschine das anhand von Regeln automatisch festlegen können? Geht halt nicht.
In meinem Beispiel geht das deswegen noch automatisch, weil es das vCenter eines einzelnen Kunden ist und nur eine einzige Domain als Ergänzung in Frage kommt. Jede VM, die dort keinen FQDN hat (was sich durch Regexp erfassen lässt), bekommt eben hart diesen einen Domainnamen angehängt.
Du könntest natürlich jeden (vom vCenter kommenden) Kurznamen einzeln per expliziter Regel um eine Domain ergänzen - also eine 1:1 Übersetzungstabelle, eine Regel pro VM. Dann vielleicht lieber nochmal überlegen, ob man nicht doch die VMs schon im vCenter mit FQDNs benennen kann.