Da das Attribut “Labels” im zweiten Ordner neu gesetzt wird, überschreibt es dort den Inhalt, der sonst vom übergeordneten Ordner vererbt würde. Insofern ist das erstmal korrektes Verhalten.
Dass der Nutzer das anders erwartet, weil label1 etwas anderes als label2 ist, ist die andere Sache.
Gesetzt wird da aber immer die gesamte Labelliste.
Ich empfehle deshalb, Labels niemals manuell im Setup (auf Ordnern oder Hosts) zu setzen, sondern immer nur durch automatische Prozesse (API oder Service Discovery).