Wenn das laut systemd Spezifikation so sein muss, dann wäre das ja ein Bug den man melden sollte.
Mir ist das nie aufgefallen da ich immer omd benutze um Sites bzw. deren Services zu stoppen/starten.
Wenn dass komplett ins systemd abgebildet werden muss, hätte man dann ja pro site mindestens 10 einzelne Units. Zumindest wäre mir nicht bekannt das systwemctl eine option hat mit der man einzelne Prozesse einer Unti stoppen/starten kann. Ich weis aber auch nicht alles 
Gruß
Michael