Falsch nicht direkt was. Nur was gefährliches 
→ “omd cleanup” bitte nicht benutzen das kann auch schnell mal ein System kaputt machen. Lieber normal per Paketverwaltung deinstallieren.
Das hat aber nix mit dem Problem zu tun.
Bei der Kopieraktion wird im Endeffekt die Site kopiert und umbenannt. Bei dem Umbenennen ist scheinbar nicht alles vom alten Namen richtig in den neuen umbenannt worden. Ich würde hier mal im “~/etc/check_mk/” schauen ob da noch der alte Name vorhanden ist. Vor allem in dem “Multisite” Teil der Config Dateien.