Um die Graphen komplett zu löschen:
In CEE Version muss Du die jeweiligen .rrd und .info Dateien in ~/var/check_mk/rrd/{HOSTNAME} löschen. In der RAW edition ist das ähnlich, sich einfach nach .rrd Dateien.
Wenn Du nur die falsche Stelle in den rrd Dateiien löschen möchtest, denke ich ist der einfachste Weg über rrddump und rrdrestore:
https://oss.oetiker.ch/rrdtool/doc/rrddump.en.html
Ich habe das mal for zig Jahren unter Nagios2 gemacht, kann aber nicht mehr genau sagen wie
Am besten Du machst das mal in einer Testumgebung. Ich würde das Monitoring kurz anhalten wenn Du die Änderung durchführst, damit nichts überschrieben wird.
Gruß
Michael