Oh so kompliziert?
Für obige Anforderung gibt es eine eigentlich recht einfache Lösung würde ich sagen 
Agent Seite:
fileinfo Sektion konfigurieren zur Überwachung der benötigten Ordner
Wie beschrieben sollte das Ergebnis meist leer sein oder?
CMK Seite:
Erstellen eines “File Grouping Pattern” für die überwachten Ordner. Ich weiß, dass ist etwas schwer wenn keine Daten da sind. Also am besten mit einem Testverzeichnis durchführen wo auch mal ein Output vorhanden ist.
Danach noch die Regel für diese Gruppe erstellen welche anschlägt sobald Dateien vorhanden sind.